Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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KLHL28Q9NXS3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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KLHL28Q9NXS3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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KLHL28Q9NXS3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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KLHL28Q9NXS3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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