Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms