Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms