Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms