Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms