Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms