Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms