Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms