Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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