Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms