Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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