Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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