Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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