Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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