Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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