Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARHGEF6Q15052 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms