Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms