Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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