Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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BPTFQ12830 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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BPTFQ12830 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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BPTFQ12830 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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BPTFQ12830 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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