Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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EFEMP1Q12805 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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EFEMP1Q12805 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFEMP1Q12805 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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