Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms