Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms