Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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