Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIRAP54198 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIRAP54198 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIRAP54198 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms