Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNA2P51530 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNA2P51530 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms