Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms