Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms