Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms