Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms