Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms