Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCCBP05166 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms