Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms