Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPLO60437 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPLO60437 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPLO60437 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPLO60437 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms