Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB3O43889 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms