Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms