Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT82Q9NSB4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT82Q9NSB4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms