Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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