Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PARD6AQ9NPB6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms