Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNPLA8Q9NP80 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms