Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms