Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEIL2Q969S2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms