Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms