Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms