Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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