Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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