Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COX10Q12887 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms