Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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