Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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