Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms