Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms